Kariyerinde bugüne kadar Uluslararası Para Fonu (IMF), Uluslararası Finans Enstitüsü, Credit Suisse gibi kurumlarda ekonomist olarak görev alan Murat Üçer; 2001’de Hazine ve 1997’de T.C. Merkez Bankası olmak üzere üst düzey danışmanlık görevlerinde bulunmuştur
Halen Global Source Türkiye danışmanlığını yapmaktadır. Turkey Data Monitor kurucuğu ortağı ve Koç Üniversitesinde yarı-zaman öğretim üyesidir. Finans kuruluşlarına, uluslararası firmalara ve kamu kurumlarına makroekonomik danışmanlık yapmakta; Türkiye ekonomisi ve küresel ekonomi üzerine makro seminerler vermektedir.
Lisans ve Doktora derecelerini sırasıyla Boğaziçi Üniversitesi ve Boston College’dan alan Üçer’in Türkiye ekonomisi üzerine çok sayıda makalesinin yanı sıra Türkiye’de 2001 krizi üzerine yayınlanmış bir kitabı bulunmaktadır.