1972' de İstanbul'da doğdu. 1991'de Saint Joseph Lisesi'ni bitirdi ve Marmara Üniversitesi Sinema TV bölümüne girdi. 1993’ten sonra gerçekleştirdiği beş kısa filmle ulusal ve uluslararası festivallerde bir çok ödül kazandı. Bunların en önemlisi 2002’de Fransa’da Clermont Ferrand’da kazandığı ödüldür. Profesyonel olarak reklam filmi sektöründe kurguculuk, yönetmen yardımcılığı ve sonrasında yönetmenlik yapan Canikligil aynı süreçte sayısız kısa filmde kameramanlık, kurguculuk yaptı, bir çok kısa film yarışmasında jüri üyeliği yaptı, çeşitli üniversitelerde Kısa Film Atölyeleri yönetti ve kısa film üzerine aralıklı olarak yazılar yazdı. Sinema alanında doktorasını 2002’de tamamlayan ve aynı yıl yardımcı doçent olarak atanan İlker Canikligil 1999 - 2006 yılları arasında İstanbul Bilgi Üniversitesi Sinema TV Bölümünde tam zamanlı olarak bir çok ders verdi. 2005 yılında dünyaca ünlü kurgucu Walter Murch’un “In The Blink of An Eye” adlı kitabını “Göz Kırparken” adıyla dilimize çevirdi. Kitap Bilgi Yayınları tarafından yayımlandı. 2006’da üniversiteden ayrıldı. Aynı yıl “Gen” adlı uzun metraj filmi kurguladı ve Adana Film Festivali’nde “En İyi Kurgu” ödülünü kazandı. 2006’dan başlayarak serbest reklam yönetmeni olarak birçok reklam filmi ve müzik video yöneten Canikligil, aynı zamanda fotoğraf alanında da çalışmaya başladı ve 2013 yılında Contemporary Istanbul’a katıldı. Aynı yıl Zorlu Performans Sanatları Merkezi’nde sayısal manipülasyonla çoğaltılmış mimari fotoğraflardan oluşan ilk solo sergisi “Çok Aslında Azdır / More is Less”i açtı. Canikligil dijital video ve fotoğraf üzerinde durduğu ve çok takip edilen kişisel blogunda yeni teknolojiler, fotoğraf ve sinemayla ilgili yazılar yazmakta, gelen teknik ve estetik soruları yanıtlamakta ve aralıklı olarak üretime yönelik kısa film atölyeleri düzenlemektedir.