Fernando Sanz 16 yıl boyunca  Real Madrid akademisinde  oynamıştır.Bunun yanında 1993-94 ve  1994-95 sezonları olmak üzere iki sezon boyunca Real Madrid'in ikinci ligde bulunan B takımında forma giymiştir. 1999-2000 sezonu başı itibari ile Fernando Sanz 7 yıl boyunca  Malaga'nın kaptanlığını yapmıştır. 2002 yılında takımıyla UEFA Intertoto kupası şampiyonluğu yaşamıştır. Sanz 2006 yılında kulübün içinde bulunduğu kötü ekonomik koşullardan kurtulabilmesine katkı sağlamak amacıyla futbolu bıraktı. Kulübü kurtarma girişimi olarak aceleci bir şekilde futbolu bırakmış ve 42 milyon Euro  borcu olan kulübün hisselerinin %98'ini tek başına satın almıştır ve kulübün başkanı olmuştur. Kulübün mali durumunu istikrarlı hale getirdikten ve geliştirdikten sonra 27 Temmuz 2010 tarihinde kulüp başkanlığını bırakmıştır. Sanz'ın başkanlığı döneminde artık bir La Liga takımı olmuş olan  Malaga 2010 yazı başında Katarlı  Al-Thani ailesine satılmıştır. Fernando Sanz  görev yaptığı dönemde İspanya Futbol Federasyonu'nun yüksek vizyon sahibi bir üyesi olmuştur.Federasyonda bulunduğu dönemde EURO 2008 ve 2010 Dünya Kupası kazanılmıştır. Fernando Sanz La Liga’nın ilk Küresel Elçisidir.